Okres okupacji niemieckiej, udział w konspiracji 1939-1944:
W czasie okupacji pracował w konspiracyjnym Instytucie Lotnictwa. Był współkonstruktorem nowego gwiazdowego silnika lotniczego.Wspólnie ze Zbigniewem Brzoską i Kazimierzem Szałwińskim opracował projekt turbinowego silnika lotniczego. W celu przeprowadzenia prób, w Zakładzie Przyrządów Precyzyjnych inż. A. Maksymowicza przy ul. Wroniej, przed wybuchem Powstania Warszawskiego wykonano łopatki do turbiny tego silnika. Projekt koncepcyjny tego silnika prawdopodobnie po wojnie sprzedano nieoficjalnie francuskiej wytwórni silników Turbomeca. Stworzył też projekt śmigłowca, któremu nadał nazwę „Ciocia Felcia”. Był jednym z filarów wywiadu lotniczego Armii Krajowej. Wchodził również w skład komisji specjalistów, która odtworzyła konstrukcję pocisku V-1 (gdy 20 maja 1944 r., niewypał rakiety V-2 spadł koło Sarnak nad Bugiem i został zdobyty przez AK najważniejsze jego elementy zostały pomierzone i sfotografowane, a część z nich przewieziono do Warszawy, gdzie naukowcy: prof. Marceli Struszyński, prof. Janusz Groszkowski, inż. Antoni Kocjan i inż. Stefan Waciórski sporządzili precyzyjne, profesjonalne studium broni, o której, oprócz jej konstruktorów, nie wiedział jeszcze nikt na świecie. Anglicy byli tak zainteresowani wynikami polskiego wywiadu, że po raport o pociskach wysłali z Włoch samolot który w nocy 26 lipca wylądował w okupowanej Polsce koło wsi Zabawa pod Tarnowem.) W styczniu 1943 r. dzięki Stefanowi Waciórskiemu Jurek Rencki rozpoczął rozmowy w sprawie wydawania pisma młodzieży lotniczej pod nazwą "Wzlot". Redaktorem naczelnym pisma została Maria Kann. Do redakcji weszli: kpt. Inż. Maciej Kalenkiewicz ps. "Kotwicz", Jerzy Rencki, inż. Stefan Waciórski. Współpracowali z redakcją m.in.: kpt. Adam Borys ps. "Pług", wybitny przedwojenny pilot Tadeusz Derengowski, specjalista w zakresie wyposażenia samolotów inż. Stanisław Madejski.
Miejsce pochówku:
Pochowany tymczasowo przy ul. Odolańskiej 14 w podwórzu, po prawej stronie - mogiła zbiorowa. W tym samym grobie pochowani zostali: Aleksander Ruksiński [?], Jan Krzyżkiewicz [ps. "Pas"], pozostałe osoby NN
Źródła:
MPW-baza uczestników PW, MPW-baza Mur Pamięci, wpis za Arch. środ. "Kryska". PCK-kartoteka, Wojenne wspomnienia Marka Tadeusza Nowakowskiego - żołnierza z "Lawy" - Warszawskie Koło Lotnicze 1941-1944, dostęp: http://www.sppw1944.org/index.html?http://www.sppw1944.org/relacje/relacja29c.html